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Die Genomanalyse ist eine wichtige Methode zur Verbesserung der Krankheitserkennung und -behandlung. Die Einführung von Sequenzierungstechniken der nächsten Generation ermöglicht die Erzeugung von Genomdaten für die Genomanalyse in kürzerer Zeit und zu angemessenen Kosten. Um trotz der ständig wachsenden Menge an Genomdaten eine schnelle und zuverlässige Genomanalyse durchführen zu können, müssen auch die Techniken zur Verwaltung und Analyse von Genomdaten verbessert werden. In diesem Projekt entwickeln wir Konzepte und Ansätze, um moderne Datenbankmanagementsysteme (z.B. spaltenorientierte In-Memory-Datenbankmanagementsysteme) für die Genomanalyse zu nutzen. Umfang des Projekts:

• Identifikation und Evaluierung von Anwendungsfällen der Genomanalyse, die sich für eine Datenbankunterstützung eignen
• Entwicklung von Datenmanagementkonzepten für die Genomanalyse unter Verwendung moderner Datenbanktechnologie unter Berücksichtigung ausgewählter Anwendungsfälle und Datenmanagementaspekte wie Datenintegration, Datenintegrität, Datenprovenienz, Datensicherheit
• Entwicklung von effizienten Datenstrukturen zur Abfrage und Verarbeitung von Genomdaten in Datenbanken für definierte Anwendungsfälle
• Nutzung moderner Hardwarekapazitäten für die Genomdatenverarbeitung

Dieser Text wurde mit DeepL übersetzt am 10.11.2025