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Durch das Hochwasser im Juni 2013 hat die Evangelische Kirche Mitteldeutschland erhebliche Gebäudeschäden erlitten. Zur Prävention von Hochwasserschäden führt die EKM das von der Deutschen Bundesstiftung Umwelt anteilig geförderte Projekt durch, an dem das Institut für Geowissenschaften und Geographie mit dem Fachgebiet Hydro- und Umweltgeologie beteiligt ist. Die sechs betroffenen Kirchengemeinden unterstützen die Finanzierung ebenfalls durch Landesmittel für die Hochwassersanierung. Im Rahmen des Projektes werden durch die MLU die Objekte hydrogeologisch untersucht, Grundwassermessstellen installiert, Konzepte für die Vermeidung künftiger Schäden erarbeitet und Teile der Ausführung übernommen sowie ein längerfristiges Monitoring etabliert.