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nCounter MAX Analysis System (NanoString Technologies, Inc.)

Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg

Medizinische Fakultät

Institut für Pathologie

Haus 28

Leipziger Str. 44

39120 Magdeburg

Tel.:+49 391 6715817

Fax:+49 391 6715818

http://www.ipa.ovgu.de/

ipa@med.ovgu.de

Gerätebeschreibung

Das nCounter MAX Analysis System ist ein Analysegerät für RNA (mRNA, miRNA, lncRNA) und DNA. Um limitiertes Patientengewebe optimal auszunutzen, können simultan Messungen von RNA und DNA durchgeführt werden. So können zum Beispiel neben isolierter RNA auch Zell- und Gewebelysate, Vollblut, Kryo- und FFPE-Gewebe ohne vorherige RNA-Isolation genutzt werden. Dadurch kann eine weitere Beschädigung der RNA verringert werden. Da das System auf der Hybridisierung von Barcode-Molekülen mit dem jeweiligen Target basiert und nicht wie üblicherweise auf Amplifikationen, ist es sehr sensitiv und kann eine einzige Kopie eines Moleküls in einer Zelle detektieren (100 ng total RNA oder Lysate von 10.000 Zellen). Für die Analyse hat NanoString bereits vorgefertigte Panel mit bis zu 800 Genen (in den Bereichen: Onkologie, Immunologie, Regenerative Medizin, Zelluläre Therapie, Gentherapie, Kardiovaskuläre Erkrankungen und Neurowissenschaften – Panel Selection Tool: https://nanostring.com/products/ncounter-assays-panels/panel-selection-tool/) zusammengestellt, welche um bis zu 55 individuelle Gene erweitert werden können. Sollten die vorgefertigten Panel nicht alle gewünschten Ziele abdecken, ist auch die Zusammenstellung eines ganz individuellen Panels möglich (wenn die Sequenz bekannt ist, kann das Team von NanoString einen entsprechenden Sonde mit Barcode entwickeln). Die Durchführung von der Probe bis zum Ergebnis dauert nur 24 h, wobei händisch nur 15 min benötigt werden. Die Auswertung der Daten erfolgt mit einer Software von NanoString, welche intuitiv und ohne großes bioinformatischen Vorwissen möglich ist.